法律分析：根据相关法律法规，保险公司在对车辆事故进行赔偿时，需要对事故车辆进行评估和鉴定，并将车辆留存作为证据。但是，如果被保险人不同意保留事故车辆，是否会影响赔偿呢？根据相关法律规定，如果被保险人不同意保留事故车辆，可能会对赔偿产生一定的影响。因为事故车辆是确定事故责任和评估损失的重要证据，如果没有事故车辆作为依据，保险公司可能难以准确评估损失金额。
法律依据：
1.《保险法》第三十五条规定：保险人对保险事故负责赔偿，被保险人或者受益人对保险金的要求权，自保险标的毁损或者灭失之日起发生。
2.《交通事故处理程序规定》第十规定：保险公司需要对车辆事故进行评估和鉴定，并将车辆留存作为证据。
3.《保险法》第六十规定：被保险人发生保险事故后，应当立即采取必要的救助和保护措施，保全保险标的，防止损失的扩大。
4.《合同法》第一百一十六条规定：当事人对合同的解释发生争议的，可以请求人民或者仲裁机构根据当事人的意愿和合同的性质、目的以及有关法律规定进行解释。